Standardmäßig unterstützt jede Software mehrere Dateiendungen. Iconographer unterstützt mindestens 2 verschiedene Dateiendungen. Die von Iconographer unterstützten Basisdateien sind .ICO. Es werden jedoch nicht immer alle in der Liste aufgeführten Dateiendungen verwendet, um die Auswirkungen der Arbeit in Iconographer zu speichern. Sehr oft werden Dateien mit solchen Dateiendungen als Quelldatendateien verwendet, die von Iconographer verwendet werden.
Mit Iconographer können Dateiformate zwischen den unten aufgeführten Dateiendungen konvertiert werden. Sie können eine Datei mit einer der folgenden Dateiendungen über Iconographer öffnen und versuchen, sie in einem anderen, ebenfalls von Iconographer unterstützten Dateiformat zu speichern.