Standardmäßig unterstützt jede Software mehrere Dateiendungen. darktable unterstützt mindestens 30 verschiedene Dateiendungen. Die von darktable unterstützten Basisdateien sind .CR2. Es werden jedoch nicht immer alle in der Liste aufgeführten Dateiendungen verwendet, um die Auswirkungen der Arbeit in darktable zu speichern. Sehr oft werden Dateien mit solchen Dateiendungen als Quelldatendateien verwendet, die von darktable verwendet werden.
Mit darktable können Dateiformate zwischen den unten aufgeführten Dateiendungen konvertiert werden. Sie können eine Datei mit einer der folgenden Dateiendungen über darktable öffnen und versuchen, sie in einem anderen, ebenfalls von darktable unterstützten Dateiformat zu speichern.