Standardmäßig unterstützt jede Software mehrere Dateiendungen. Zune Video Converter unterstützt mindestens 6 verschiedene Dateiendungen. Die von Zune Video Converter unterstützten Basisdateien sind .MOV. Es werden jedoch nicht immer alle in der Liste aufgeführten Dateiendungen verwendet, um die Auswirkungen der Arbeit in Zune Video Converter zu speichern. Sehr oft werden Dateien mit solchen Dateiendungen als Quelldatendateien verwendet, die von Zune Video Converter verwendet werden.
Mit Zune Video Converter können Dateiformate zwischen den unten aufgeführten Dateiendungen konvertiert werden. Sie können eine Datei mit einer der folgenden Dateiendungen über Zune Video Converter öffnen und versuchen, sie in einem anderen, ebenfalls von Zune Video Converter unterstützten Dateiformat zu speichern.