Standardmäßig unterstützt jede Software mehrere Dateiendungen. ZipSplitter unterstützt mindestens 8 verschiedene Dateiendungen. Die von ZipSplitter unterstützten Basisdateien sind .S01. Es werden jedoch nicht immer alle in der Liste aufgeführten Dateiendungen verwendet, um die Auswirkungen der Arbeit in ZipSplitter zu speichern. Sehr oft werden Dateien mit solchen Dateiendungen als Quelldatendateien verwendet, die von ZipSplitter verwendet werden.
Mit ZipSplitter können Dateiformate zwischen den unten aufgeführten Dateiendungen konvertiert werden. Sie können eine Datei mit einer der folgenden Dateiendungen über ZipSplitter öffnen und versuchen, sie in einem anderen, ebenfalls von ZipSplitter unterstützten Dateiformat zu speichern.