Standardmäßig unterstützt jede Software mehrere Dateiendungen. ZCwinEHE unterstützt mindestens 2 verschiedene Dateiendungen. Die von ZCwinEHE unterstützten Basisdateien sind .SBL. Es werden jedoch nicht immer alle in der Liste aufgeführten Dateiendungen verwendet, um die Auswirkungen der Arbeit in ZCwinEHE zu speichern. Sehr oft werden Dateien mit solchen Dateiendungen als Quelldatendateien verwendet, die von ZCwinEHE verwendet werden.
Mit ZCwinEHE können Dateiformate zwischen den unten aufgeführten Dateiendungen konvertiert werden. Sie können eine Datei mit einer der folgenden Dateiendungen über ZCwinEHE öffnen und versuchen, sie in einem anderen, ebenfalls von ZCwinEHE unterstützten Dateiformat zu speichern.