Standardmäßig unterstützt jede Software mehrere Dateiendungen. yEnc unterstützt mindestens 1 verschiedene Dateiendungen. Die von yEnc unterstützten Basisdateien sind .YENC. Es werden jedoch nicht immer alle in der Liste aufgeführten Dateiendungen verwendet, um die Auswirkungen der Arbeit in yEnc zu speichern. Sehr oft werden Dateien mit solchen Dateiendungen als Quelldatendateien verwendet, die von yEnc verwendet werden.
Mit yEnc können Dateiformate zwischen den unten aufgeführten Dateiendungen konvertiert werden. Sie können eine Datei mit einer der folgenden Dateiendungen über yEnc öffnen und versuchen, sie in einem anderen, ebenfalls von yEnc unterstützten Dateiformat zu speichern.