Standardmäßig unterstützt jede Software mehrere Dateiendungen. Yamaha Studio Manager unterstützt mindestens 2 verschiedene Dateiendungen. Die von Yamaha Studio Manager unterstützten Basisdateien sind .YSM. Es werden jedoch nicht immer alle in der Liste aufgeführten Dateiendungen verwendet, um die Auswirkungen der Arbeit in Yamaha Studio Manager zu speichern. Sehr oft werden Dateien mit solchen Dateiendungen als Quelldatendateien verwendet, die von Yamaha Studio Manager verwendet werden.
Mit Yamaha Studio Manager können Dateiformate zwischen den unten aufgeführten Dateiendungen konvertiert werden. Sie können eine Datei mit einer der folgenden Dateiendungen über Yamaha Studio Manager öffnen und versuchen, sie in einem anderen, ebenfalls von Yamaha Studio Manager unterstützten Dateiformat zu speichern.