Standardmäßig unterstützt jede Software mehrere Dateiendungen. XRY unterstützt mindestens 1 verschiedene Dateiendungen. Die von XRY unterstützten Basisdateien sind .XRY. Es werden jedoch nicht immer alle in der Liste aufgeführten Dateiendungen verwendet, um die Auswirkungen der Arbeit in XRY zu speichern. Sehr oft werden Dateien mit solchen Dateiendungen als Quelldatendateien verwendet, die von XRY verwendet werden.
Mit XRY können Dateiformate zwischen den unten aufgeführten Dateiendungen konvertiert werden. Sie können eine Datei mit einer der folgenden Dateiendungen über XRY öffnen und versuchen, sie in einem anderen, ebenfalls von XRY unterstützten Dateiformat zu speichern.