Standardmäßig unterstützt jede Software mehrere Dateiendungen. Xojo unterstützt mindestens 8 verschiedene Dateiendungen. Die von Xojo unterstützten Basisdateien sind .XOJO_PROJECT. Es werden jedoch nicht immer alle in der Liste aufgeführten Dateiendungen verwendet, um die Auswirkungen der Arbeit in Xojo zu speichern. Sehr oft werden Dateien mit solchen Dateiendungen als Quelldatendateien verwendet, die von Xojo verwendet werden.
Mit Xojo können Dateiformate zwischen den unten aufgeführten Dateiendungen konvertiert werden. Sie können eine Datei mit einer der folgenden Dateiendungen über Xojo öffnen und versuchen, sie in einem anderen, ebenfalls von Xojo unterstützten Dateiformat zu speichern.