Standardmäßig unterstützt jede Software mehrere Dateiendungen. XenApp unterstützt mindestens 1 verschiedene Dateiendungen. Die von XenApp unterstützten Basisdateien sind .ICA. Es werden jedoch nicht immer alle in der Liste aufgeführten Dateiendungen verwendet, um die Auswirkungen der Arbeit in XenApp zu speichern. Sehr oft werden Dateien mit solchen Dateiendungen als Quelldatendateien verwendet, die von XenApp verwendet werden.
Mit XenApp können Dateiformate zwischen den unten aufgeführten Dateiendungen konvertiert werden. Sie können eine Datei mit einer der folgenden Dateiendungen über XenApp öffnen und versuchen, sie in einem anderen, ebenfalls von XenApp unterstützten Dateiformat zu speichern.