Standardmäßig unterstützt jede Software mehrere Dateiendungen. Xamine unterstützt mindestens 1 verschiedene Dateiendungen. Die von Xamine unterstützten Basisdateien sind .CTBL. Es werden jedoch nicht immer alle in der Liste aufgeführten Dateiendungen verwendet, um die Auswirkungen der Arbeit in Xamine zu speichern. Sehr oft werden Dateien mit solchen Dateiendungen als Quelldatendateien verwendet, die von Xamine verwendet werden.
Mit Xamine können Dateiformate zwischen den unten aufgeführten Dateiendungen konvertiert werden. Sie können eine Datei mit einer der folgenden Dateiendungen über Xamine öffnen und versuchen, sie in einem anderen, ebenfalls von Xamine unterstützten Dateiformat zu speichern.