Standardmäßig unterstützt jede Software mehrere Dateiendungen. WYZTracker unterstützt mindestens 1 verschiedene Dateiendungen. Die von WYZTracker unterstützten Basisdateien sind .WYZ. Es werden jedoch nicht immer alle in der Liste aufgeführten Dateiendungen verwendet, um die Auswirkungen der Arbeit in WYZTracker zu speichern. Sehr oft werden Dateien mit solchen Dateiendungen als Quelldatendateien verwendet, die von WYZTracker verwendet werden.
Mit WYZTracker können Dateiformate zwischen den unten aufgeführten Dateiendungen konvertiert werden. Sie können eine Datei mit einer der folgenden Dateiendungen über WYZTracker öffnen und versuchen, sie in einem anderen, ebenfalls von WYZTracker unterstützten Dateiformat zu speichern.