Standardmäßig unterstützt jede Software mehrere Dateiendungen. Workshare Compare unterstützt mindestens 1 verschiedene Dateiendungen. Die von Workshare Compare unterstützten Basisdateien sind .WDF. Es werden jedoch nicht immer alle in der Liste aufgeführten Dateiendungen verwendet, um die Auswirkungen der Arbeit in Workshare Compare zu speichern. Sehr oft werden Dateien mit solchen Dateiendungen als Quelldatendateien verwendet, die von Workshare Compare verwendet werden.
Mit Workshare Compare können Dateiformate zwischen den unten aufgeführten Dateiendungen konvertiert werden. Sie können eine Datei mit einer der folgenden Dateiendungen über Workshare Compare öffnen und versuchen, sie in einem anderen, ebenfalls von Workshare Compare unterstützten Dateiformat zu speichern.