Standardmäßig unterstützt jede Software mehrere Dateiendungen. WolfQuest unterstützt mindestens 1 verschiedene Dateiendungen. Die von WolfQuest unterstützten Basisdateien sind .WOLFQUEST. Es werden jedoch nicht immer alle in der Liste aufgeführten Dateiendungen verwendet, um die Auswirkungen der Arbeit in WolfQuest zu speichern. Sehr oft werden Dateien mit solchen Dateiendungen als Quelldatendateien verwendet, die von WolfQuest verwendet werden.
Mit WolfQuest können Dateiformate zwischen den unten aufgeführten Dateiendungen konvertiert werden. Sie können eine Datei mit einer der folgenden Dateiendungen über WolfQuest öffnen und versuchen, sie in einem anderen, ebenfalls von WolfQuest unterstützten Dateiformat zu speichern.