Standardmäßig unterstützt jede Software mehrere Dateiendungen. WinHKI Archiver unterstützt mindestens 4 verschiedene Dateiendungen. Die von WinHKI Archiver unterstützten Basisdateien sind .HKI. Es werden jedoch nicht immer alle in der Liste aufgeführten Dateiendungen verwendet, um die Auswirkungen der Arbeit in WinHKI Archiver zu speichern. Sehr oft werden Dateien mit solchen Dateiendungen als Quelldatendateien verwendet, die von WinHKI Archiver verwendet werden.
Mit WinHKI Archiver können Dateiformate zwischen den unten aufgeführten Dateiendungen konvertiert werden. Sie können eine Datei mit einer der folgenden Dateiendungen über WinHKI Archiver öffnen und versuchen, sie in einem anderen, ebenfalls von WinHKI Archiver unterstützten Dateiformat zu speichern.