Standardmäßig unterstützt jede Software mehrere Dateiendungen. Wiimms WDF Tool unterstützt mindestens 1 verschiedene Dateiendungen. Die von Wiimms WDF Tool unterstützten Basisdateien sind .WIA. Es werden jedoch nicht immer alle in der Liste aufgeführten Dateiendungen verwendet, um die Auswirkungen der Arbeit in Wiimms WDF Tool zu speichern. Sehr oft werden Dateien mit solchen Dateiendungen als Quelldatendateien verwendet, die von Wiimms WDF Tool verwendet werden.
Mit Wiimms WDF Tool können Dateiformate zwischen den unten aufgeführten Dateiendungen konvertiert werden. Sie können eine Datei mit einer der folgenden Dateiendungen über Wiimms WDF Tool öffnen und versuchen, sie in einem anderen, ebenfalls von Wiimms WDF Tool unterstützten Dateiformat zu speichern.