Standardmäßig unterstützt jede Software mehrere Dateiendungen. WhineCube unterstützt mindestens 1 verschiedene Dateiendungen. Die von WhineCube unterstützten Basisdateien sind .GCM. Es werden jedoch nicht immer alle in der Liste aufgeführten Dateiendungen verwendet, um die Auswirkungen der Arbeit in WhineCube zu speichern. Sehr oft werden Dateien mit solchen Dateiendungen als Quelldatendateien verwendet, die von WhineCube verwendet werden.
Mit WhineCube können Dateiformate zwischen den unten aufgeführten Dateiendungen konvertiert werden. Sie können eine Datei mit einer der folgenden Dateiendungen über WhineCube öffnen und versuchen, sie in einem anderen, ebenfalls von WhineCube unterstützten Dateiformat zu speichern.