Standardmäßig unterstützt jede Software mehrere Dateiendungen. WaveReader unterstützt mindestens 1 verschiedene Dateiendungen. Die von WaveReader unterstützten Basisdateien sind .60D. Es werden jedoch nicht immer alle in der Liste aufgeführten Dateiendungen verwendet, um die Auswirkungen der Arbeit in WaveReader zu speichern. Sehr oft werden Dateien mit solchen Dateiendungen als Quelldatendateien verwendet, die von WaveReader verwendet werden.
Mit WaveReader können Dateiformate zwischen den unten aufgeführten Dateiendungen konvertiert werden. Sie können eine Datei mit einer der folgenden Dateiendungen über WaveReader öffnen und versuchen, sie in einem anderen, ebenfalls von WaveReader unterstützten Dateiformat zu speichern.