Standardmäßig unterstützt jede Software mehrere Dateiendungen. WavePad unterstützt mindestens 1 verschiedene Dateiendungen. Die von WavePad unterstützten Basisdateien sind .M4A. Es werden jedoch nicht immer alle in der Liste aufgeführten Dateiendungen verwendet, um die Auswirkungen der Arbeit in WavePad zu speichern. Sehr oft werden Dateien mit solchen Dateiendungen als Quelldatendateien verwendet, die von WavePad verwendet werden.
Mit WavePad können Dateiformate zwischen den unten aufgeführten Dateiendungen konvertiert werden. Sie können eine Datei mit einer der folgenden Dateiendungen über WavePad öffnen und versuchen, sie in einem anderen, ebenfalls von WavePad unterstützten Dateiformat zu speichern.