Standardmäßig unterstützt jede Software mehrere Dateiendungen. WatchDirectory unterstützt mindestens 1 verschiedene Dateiendungen. Die von WatchDirectory unterstützten Basisdateien sind .CONFIG. Es werden jedoch nicht immer alle in der Liste aufgeführten Dateiendungen verwendet, um die Auswirkungen der Arbeit in WatchDirectory zu speichern. Sehr oft werden Dateien mit solchen Dateiendungen als Quelldatendateien verwendet, die von WatchDirectory verwendet werden.
Mit WatchDirectory können Dateiformate zwischen den unten aufgeführten Dateiendungen konvertiert werden. Sie können eine Datei mit einer der folgenden Dateiendungen über WatchDirectory öffnen und versuchen, sie in einem anderen, ebenfalls von WatchDirectory unterstützten Dateiformat zu speichern.