Standardmäßig unterstützt jede Software mehrere Dateiendungen. Wandora unterstützt mindestens 1 verschiedene Dateiendungen. Die von Wandora unterstützten Basisdateien sind .RIS. Es werden jedoch nicht immer alle in der Liste aufgeführten Dateiendungen verwendet, um die Auswirkungen der Arbeit in Wandora zu speichern. Sehr oft werden Dateien mit solchen Dateiendungen als Quelldatendateien verwendet, die von Wandora verwendet werden.
Mit Wandora können Dateiformate zwischen den unten aufgeführten Dateiendungen konvertiert werden. Sie können eine Datei mit einer der folgenden Dateiendungen über Wandora öffnen und versuchen, sie in einem anderen, ebenfalls von Wandora unterstützten Dateiformat zu speichern.