Standardmäßig unterstützt jede Software mehrere Dateiendungen. Virtual Application Studio unterstützt mindestens 1 verschiedene Dateiendungen. Die von Virtual Application Studio unterstützten Basisdateien sind .XAPPL. Es werden jedoch nicht immer alle in der Liste aufgeführten Dateiendungen verwendet, um die Auswirkungen der Arbeit in Virtual Application Studio zu speichern. Sehr oft werden Dateien mit solchen Dateiendungen als Quelldatendateien verwendet, die von Virtual Application Studio verwendet werden.
Mit Virtual Application Studio können Dateiformate zwischen den unten aufgeführten Dateiendungen konvertiert werden. Sie können eine Datei mit einer der folgenden Dateiendungen über Virtual Application Studio öffnen und versuchen, sie in einem anderen, ebenfalls von Virtual Application Studio unterstützten Dateiformat zu speichern.