Standardmäßig unterstützt jede Software mehrere Dateiendungen. Total Commander unterstützt mindestens 43 verschiedene Dateiendungen. Die von Total Commander unterstützten Basisdateien sind .LNG. Es werden jedoch nicht immer alle in der Liste aufgeführten Dateiendungen verwendet, um die Auswirkungen der Arbeit in Total Commander zu speichern. Sehr oft werden Dateien mit solchen Dateiendungen als Quelldatendateien verwendet, die von Total Commander verwendet werden.
Mit Total Commander können Dateiformate zwischen den unten aufgeführten Dateiendungen konvertiert werden. Sie können eine Datei mit einer der folgenden Dateiendungen über Total Commander öffnen und versuchen, sie in einem anderen, ebenfalls von Total Commander unterstützten Dateiformat zu speichern.