Standardmäßig unterstützt jede Software mehrere Dateiendungen. THOR-Merlin System unterstützt mindestens 1 verschiedene Dateiendungen. Die von THOR-Merlin System unterstützten Basisdateien sind .TDT. Es werden jedoch nicht immer alle in der Liste aufgeführten Dateiendungen verwendet, um die Auswirkungen der Arbeit in THOR-Merlin System zu speichern. Sehr oft werden Dateien mit solchen Dateiendungen als Quelldatendateien verwendet, die von THOR-Merlin System verwendet werden.
Mit THOR-Merlin System können Dateiformate zwischen den unten aufgeführten Dateiendungen konvertiert werden. Sie können eine Datei mit einer der folgenden Dateiendungen über THOR-Merlin System öffnen und versuchen, sie in einem anderen, ebenfalls von THOR-Merlin System unterstützten Dateiformat zu speichern.