Standardmäßig unterstützt jede Software mehrere Dateiendungen. System Mechanic unterstützt mindestens 1 verschiedene Dateiendungen. Die von System Mechanic unterstützten Basisdateien sind .SMPRF. Es werden jedoch nicht immer alle in der Liste aufgeführten Dateiendungen verwendet, um die Auswirkungen der Arbeit in System Mechanic zu speichern. Sehr oft werden Dateien mit solchen Dateiendungen als Quelldatendateien verwendet, die von System Mechanic verwendet werden.
Mit System Mechanic können Dateiformate zwischen den unten aufgeführten Dateiendungen konvertiert werden. Sie können eine Datei mit einer der folgenden Dateiendungen über System Mechanic öffnen und versuchen, sie in einem anderen, ebenfalls von System Mechanic unterstützten Dateiformat zu speichern.