Standardmäßig unterstützt jede Software mehrere Dateiendungen. StuffIt unterstützt mindestens 37 verschiedene Dateiendungen. Die von StuffIt unterstützten Basisdateien sind .7Z. Es werden jedoch nicht immer alle in der Liste aufgeführten Dateiendungen verwendet, um die Auswirkungen der Arbeit in StuffIt zu speichern. Sehr oft werden Dateien mit solchen Dateiendungen als Quelldatendateien verwendet, die von StuffIt verwendet werden.
Mit StuffIt können Dateiformate zwischen den unten aufgeführten Dateiendungen konvertiert werden. Sie können eine Datei mit einer der folgenden Dateiendungen über StuffIt öffnen und versuchen, sie in einem anderen, ebenfalls von StuffIt unterstützten Dateiformat zu speichern.