Standardmäßig unterstützt jede Software mehrere Dateiendungen. StudioMDL unterstützt mindestens 2 verschiedene Dateiendungen. Die von StudioMDL unterstützten Basisdateien sind .SMD. Es werden jedoch nicht immer alle in der Liste aufgeführten Dateiendungen verwendet, um die Auswirkungen der Arbeit in StudioMDL zu speichern. Sehr oft werden Dateien mit solchen Dateiendungen als Quelldatendateien verwendet, die von StudioMDL verwendet werden.
Mit StudioMDL können Dateiformate zwischen den unten aufgeführten Dateiendungen konvertiert werden. Sie können eine Datei mit einer der folgenden Dateiendungen über StudioMDL öffnen und versuchen, sie in einem anderen, ebenfalls von StudioMDL unterstützten Dateiformat zu speichern.