Standardmäßig unterstützt jede Software mehrere Dateiendungen. StereoPhoto Maker unterstützt mindestens 2 verschiedene Dateiendungen. Die von StereoPhoto Maker unterstützten Basisdateien sind .MPO. Es werden jedoch nicht immer alle in der Liste aufgeführten Dateiendungen verwendet, um die Auswirkungen der Arbeit in StereoPhoto Maker zu speichern. Sehr oft werden Dateien mit solchen Dateiendungen als Quelldatendateien verwendet, die von StereoPhoto Maker verwendet werden.
Mit StereoPhoto Maker können Dateiformate zwischen den unten aufgeführten Dateiendungen konvertiert werden. Sie können eine Datei mit einer der folgenden Dateiendungen über StereoPhoto Maker öffnen und versuchen, sie in einem anderen, ebenfalls von StereoPhoto Maker unterstützten Dateiformat zu speichern.