Standardmäßig unterstützt jede Software mehrere Dateiendungen. StarCraft II unterstützt mindestens 17 verschiedene Dateiendungen. Die von StarCraft II unterstützten Basisdateien sind .MFIL. Es werden jedoch nicht immer alle in der Liste aufgeführten Dateiendungen verwendet, um die Auswirkungen der Arbeit in StarCraft II zu speichern. Sehr oft werden Dateien mit solchen Dateiendungen als Quelldatendateien verwendet, die von StarCraft II verwendet werden.
Mit StarCraft II können Dateiformate zwischen den unten aufgeführten Dateiendungen konvertiert werden. Sie können eine Datei mit einer der folgenden Dateiendungen über StarCraft II öffnen und versuchen, sie in einem anderen, ebenfalls von StarCraft II unterstützten Dateiformat zu speichern.