Standardmäßig unterstützt jede Software mehrere Dateiendungen. sseq2mid unterstützt mindestens 1 verschiedene Dateiendungen. Die von sseq2mid unterstützten Basisdateien sind .SSEQ. Es werden jedoch nicht immer alle in der Liste aufgeführten Dateiendungen verwendet, um die Auswirkungen der Arbeit in sseq2mid zu speichern. Sehr oft werden Dateien mit solchen Dateiendungen als Quelldatendateien verwendet, die von sseq2mid verwendet werden.
Mit sseq2mid können Dateiformate zwischen den unten aufgeführten Dateiendungen konvertiert werden. Sie können eine Datei mit einer der folgenden Dateiendungen über sseq2mid öffnen und versuchen, sie in einem anderen, ebenfalls von sseq2mid unterstützten Dateiformat zu speichern.