Standardmäßig unterstützt jede Software mehrere Dateiendungen. Spybot - Search & Destroy unterstützt mindestens 6 verschiedene Dateiendungen. Die von Spybot - Search & Destroy unterstützten Basisdateien sind .SBS. Es werden jedoch nicht immer alle in der Liste aufgeführten Dateiendungen verwendet, um die Auswirkungen der Arbeit in Spybot - Search & Destroy zu speichern. Sehr oft werden Dateien mit solchen Dateiendungen als Quelldatendateien verwendet, die von Spybot - Search & Destroy verwendet werden.
Mit Spybot - Search & Destroy können Dateiformate zwischen den unten aufgeführten Dateiendungen konvertiert werden. Sie können eine Datei mit einer der folgenden Dateiendungen über Spybot - Search & Destroy öffnen und versuchen, sie in einem anderen, ebenfalls von Spybot - Search & Destroy unterstützten Dateiformat zu speichern.