Standardmäßig unterstützt jede Software mehrere Dateiendungen. SmartEncryptor unterstützt mindestens 1 verschiedene Dateiendungen. Die von SmartEncryptor unterstützten Basisdateien sind .SME. Es werden jedoch nicht immer alle in der Liste aufgeführten Dateiendungen verwendet, um die Auswirkungen der Arbeit in SmartEncryptor zu speichern. Sehr oft werden Dateien mit solchen Dateiendungen als Quelldatendateien verwendet, die von SmartEncryptor verwendet werden.
Mit SmartEncryptor können Dateiformate zwischen den unten aufgeführten Dateiendungen konvertiert werden. Sie können eine Datei mit einer der folgenden Dateiendungen über SmartEncryptor öffnen und versuchen, sie in einem anderen, ebenfalls von SmartEncryptor unterstützten Dateiformat zu speichern.