Standardmäßig unterstützt jede Software mehrere Dateiendungen. SeeYou unterstützt mindestens 9 verschiedene Dateiendungen. Die von SeeYou unterstützten Basisdateien sind .DAT. Es werden jedoch nicht immer alle in der Liste aufgeführten Dateiendungen verwendet, um die Auswirkungen der Arbeit in SeeYou zu speichern. Sehr oft werden Dateien mit solchen Dateiendungen als Quelldatendateien verwendet, die von SeeYou verwendet werden.
Mit SeeYou können Dateiformate zwischen den unten aufgeführten Dateiendungen konvertiert werden. Sie können eine Datei mit einer der folgenden Dateiendungen über SeeYou öffnen und versuchen, sie in einem anderen, ebenfalls von SeeYou unterstützten Dateiformat zu speichern.