Standardmäßig unterstützt jede Software mehrere Dateiendungen. SecureDocs unterstützt mindestens 1 verschiedene Dateiendungen. Die von SecureDocs unterstützten Basisdateien sind .SECURE. Es werden jedoch nicht immer alle in der Liste aufgeführten Dateiendungen verwendet, um die Auswirkungen der Arbeit in SecureDocs zu speichern. Sehr oft werden Dateien mit solchen Dateiendungen als Quelldatendateien verwendet, die von SecureDocs verwendet werden.
Mit SecureDocs können Dateiformate zwischen den unten aufgeführten Dateiendungen konvertiert werden. Sie können eine Datei mit einer der folgenden Dateiendungen über SecureDocs öffnen und versuchen, sie in einem anderen, ebenfalls von SecureDocs unterstützten Dateiformat zu speichern.