Standardmäßig unterstützt jede Software mehrere Dateiendungen. SeaMonkey unterstützt mindestens 17 verschiedene Dateiendungen. Die von SeaMonkey unterstützten Basisdateien sind .XPI. Es werden jedoch nicht immer alle in der Liste aufgeführten Dateiendungen verwendet, um die Auswirkungen der Arbeit in SeaMonkey zu speichern. Sehr oft werden Dateien mit solchen Dateiendungen als Quelldatendateien verwendet, die von SeaMonkey verwendet werden.
Mit SeaMonkey können Dateiformate zwischen den unten aufgeführten Dateiendungen konvertiert werden. Sie können eine Datei mit einer der folgenden Dateiendungen über SeaMonkey öffnen und versuchen, sie in einem anderen, ebenfalls von SeaMonkey unterstützten Dateiformat zu speichern.