Standardmäßig unterstützt jede Software mehrere Dateiendungen. ScreenFlow unterstützt mindestens 1 verschiedene Dateiendungen. Die von ScreenFlow unterstützten Basisdateien sind .SCREENFLOW. Es werden jedoch nicht immer alle in der Liste aufgeführten Dateiendungen verwendet, um die Auswirkungen der Arbeit in ScreenFlow zu speichern. Sehr oft werden Dateien mit solchen Dateiendungen als Quelldatendateien verwendet, die von ScreenFlow verwendet werden.
Mit ScreenFlow können Dateiformate zwischen den unten aufgeführten Dateiendungen konvertiert werden. Sie können eine Datei mit einer der folgenden Dateiendungen über ScreenFlow öffnen und versuchen, sie in einem anderen, ebenfalls von ScreenFlow unterstützten Dateiformat zu speichern.