Standardmäßig unterstützt jede Software mehrere Dateiendungen. RFFlow unterstützt mindestens 1 verschiedene Dateiendungen. Die von RFFlow unterstützten Basisdateien sind .FLO. Es werden jedoch nicht immer alle in der Liste aufgeführten Dateiendungen verwendet, um die Auswirkungen der Arbeit in RFFlow zu speichern. Sehr oft werden Dateien mit solchen Dateiendungen als Quelldatendateien verwendet, die von RFFlow verwendet werden.
Mit RFFlow können Dateiformate zwischen den unten aufgeführten Dateiendungen konvertiert werden. Sie können eine Datei mit einer der folgenden Dateiendungen über RFFlow öffnen und versuchen, sie in einem anderen, ebenfalls von RFFlow unterstützten Dateiformat zu speichern.