Standardmäßig unterstützt jede Software mehrere Dateiendungen. ReplaceEM unterstützt mindestens 1 verschiedene Dateiendungen. Die von ReplaceEM unterstützten Basisdateien sind .BKR. Es werden jedoch nicht immer alle in der Liste aufgeführten Dateiendungen verwendet, um die Auswirkungen der Arbeit in ReplaceEM zu speichern. Sehr oft werden Dateien mit solchen Dateiendungen als Quelldatendateien verwendet, die von ReplaceEM verwendet werden.
Mit ReplaceEM können Dateiformate zwischen den unten aufgeführten Dateiendungen konvertiert werden. Sie können eine Datei mit einer der folgenden Dateiendungen über ReplaceEM öffnen und versuchen, sie in einem anderen, ebenfalls von ReplaceEM unterstützten Dateiformat zu speichern.