Standardmäßig unterstützt jede Software mehrere Dateiendungen. R-Studio unterstützt mindestens 1 verschiedene Dateiendungen. Die von R-Studio unterstützten Basisdateien sind .DSK. Es werden jedoch nicht immer alle in der Liste aufgeführten Dateiendungen verwendet, um die Auswirkungen der Arbeit in R-Studio zu speichern. Sehr oft werden Dateien mit solchen Dateiendungen als Quelldatendateien verwendet, die von R-Studio verwendet werden.
Mit R-Studio können Dateiformate zwischen den unten aufgeführten Dateiendungen konvertiert werden. Sie können eine Datei mit einer der folgenden Dateiendungen über R-Studio öffnen und versuchen, sie in einem anderen, ebenfalls von R-Studio unterstützten Dateiformat zu speichern.