Standardmäßig unterstützt jede Software mehrere Dateiendungen. Quantum GIS unterstützt mindestens 3 verschiedene Dateiendungen. Die von Quantum GIS unterstützten Basisdateien sind .QPJ. Es werden jedoch nicht immer alle in der Liste aufgeführten Dateiendungen verwendet, um die Auswirkungen der Arbeit in Quantum GIS zu speichern. Sehr oft werden Dateien mit solchen Dateiendungen als Quelldatendateien verwendet, die von Quantum GIS verwendet werden.
Mit Quantum GIS können Dateiformate zwischen den unten aufgeführten Dateiendungen konvertiert werden. Sie können eine Datei mit einer der folgenden Dateiendungen über Quantum GIS öffnen und versuchen, sie in einem anderen, ebenfalls von Quantum GIS unterstützten Dateiformat zu speichern.