Standardmäßig unterstützt jede Software mehrere Dateiendungen. Quake 2 unterstützt mindestens 5 verschiedene Dateiendungen. Die von Quake 2 unterstützten Basisdateien sind .BSP. Es werden jedoch nicht immer alle in der Liste aufgeführten Dateiendungen verwendet, um die Auswirkungen der Arbeit in Quake 2 zu speichern. Sehr oft werden Dateien mit solchen Dateiendungen als Quelldatendateien verwendet, die von Quake 2 verwendet werden.
Mit Quake 2 können Dateiformate zwischen den unten aufgeführten Dateiendungen konvertiert werden. Sie können eine Datei mit einer der folgenden Dateiendungen über Quake 2 öffnen und versuchen, sie in einem anderen, ebenfalls von Quake 2 unterstützten Dateiformat zu speichern.