Standardmäßig unterstützt jede Software mehrere Dateiendungen. proTeXt unterstützt mindestens 4 verschiedene Dateiendungen. Die von proTeXt unterstützten Basisdateien sind .STY. Es werden jedoch nicht immer alle in der Liste aufgeführten Dateiendungen verwendet, um die Auswirkungen der Arbeit in proTeXt zu speichern. Sehr oft werden Dateien mit solchen Dateiendungen als Quelldatendateien verwendet, die von proTeXt verwendet werden.
Mit proTeXt können Dateiformate zwischen den unten aufgeführten Dateiendungen konvertiert werden. Sie können eine Datei mit einer der folgenden Dateiendungen über proTeXt öffnen und versuchen, sie in einem anderen, ebenfalls von proTeXt unterstützten Dateiformat zu speichern.