Standardmäßig unterstützt jede Software mehrere Dateiendungen. Priority Matrix unterstützt mindestens 1 verschiedene Dateiendungen. Die von Priority Matrix unterstützten Basisdateien sind .PMATRIX. Es werden jedoch nicht immer alle in der Liste aufgeführten Dateiendungen verwendet, um die Auswirkungen der Arbeit in Priority Matrix zu speichern. Sehr oft werden Dateien mit solchen Dateiendungen als Quelldatendateien verwendet, die von Priority Matrix verwendet werden.
Mit Priority Matrix können Dateiformate zwischen den unten aufgeführten Dateiendungen konvertiert werden. Sie können eine Datei mit einer der folgenden Dateiendungen über Priority Matrix öffnen und versuchen, sie in einem anderen, ebenfalls von Priority Matrix unterstützten Dateiformat zu speichern.