Standardmäßig unterstützt jede Software mehrere Dateiendungen. PolyTrans unterstützt mindestens 4 verschiedene Dateiendungen. Die von PolyTrans unterstützten Basisdateien sind .CATPART. Es werden jedoch nicht immer alle in der Liste aufgeführten Dateiendungen verwendet, um die Auswirkungen der Arbeit in PolyTrans zu speichern. Sehr oft werden Dateien mit solchen Dateiendungen als Quelldatendateien verwendet, die von PolyTrans verwendet werden.
Mit PolyTrans können Dateiformate zwischen den unten aufgeführten Dateiendungen konvertiert werden. Sie können eine Datei mit einer der folgenden Dateiendungen über PolyTrans öffnen und versuchen, sie in einem anderen, ebenfalls von PolyTrans unterstützten Dateiformat zu speichern.