Standardmäßig unterstützt jede Software mehrere Dateiendungen. Plex Media Center for OS X unterstützt mindestens 3 verschiedene Dateiendungen. Die von Plex Media Center for OS X unterstützten Basisdateien sind .MKV. Es werden jedoch nicht immer alle in der Liste aufgeführten Dateiendungen verwendet, um die Auswirkungen der Arbeit in Plex Media Center for OS X zu speichern. Sehr oft werden Dateien mit solchen Dateiendungen als Quelldatendateien verwendet, die von Plex Media Center for OS X verwendet werden.
Mit Plex Media Center for OS X können Dateiformate zwischen den unten aufgeführten Dateiendungen konvertiert werden. Sie können eine Datei mit einer der folgenden Dateiendungen über Plex Media Center for OS X öffnen und versuchen, sie in einem anderen, ebenfalls von Plex Media Center for OS X unterstützten Dateiformat zu speichern.