Standardmäßig unterstützt jede Software mehrere Dateiendungen. PixMaker unterstützt mindestens 1 verschiedene Dateiendungen. Die von PixMaker unterstützten Basisdateien sind .PIW. Es werden jedoch nicht immer alle in der Liste aufgeführten Dateiendungen verwendet, um die Auswirkungen der Arbeit in PixMaker zu speichern. Sehr oft werden Dateien mit solchen Dateiendungen als Quelldatendateien verwendet, die von PixMaker verwendet werden.
Mit PixMaker können Dateiformate zwischen den unten aufgeführten Dateiendungen konvertiert werden. Sie können eine Datei mit einer der folgenden Dateiendungen über PixMaker öffnen und versuchen, sie in einem anderen, ebenfalls von PixMaker unterstützten Dateiformat zu speichern.