Standardmäßig unterstützt jede Software mehrere Dateiendungen. Pico unterstützt mindestens 7 verschiedene Dateiendungen. Die von Pico unterstützten Basisdateien sind .CONF. Es werden jedoch nicht immer alle in der Liste aufgeführten Dateiendungen verwendet, um die Auswirkungen der Arbeit in Pico zu speichern. Sehr oft werden Dateien mit solchen Dateiendungen als Quelldatendateien verwendet, die von Pico verwendet werden.
Mit Pico können Dateiformate zwischen den unten aufgeführten Dateiendungen konvertiert werden. Sie können eine Datei mit einer der folgenden Dateiendungen über Pico öffnen und versuchen, sie in einem anderen, ebenfalls von Pico unterstützten Dateiformat zu speichern.