Standardmäßig unterstützt jede Software mehrere Dateiendungen. PhotoWorks unterstützt mindestens 1 verschiedene Dateiendungen. Die von PhotoWorks unterstützten Basisdateien sind .P2M. Es werden jedoch nicht immer alle in der Liste aufgeführten Dateiendungen verwendet, um die Auswirkungen der Arbeit in PhotoWorks zu speichern. Sehr oft werden Dateien mit solchen Dateiendungen als Quelldatendateien verwendet, die von PhotoWorks verwendet werden.
Mit PhotoWorks können Dateiformate zwischen den unten aufgeführten Dateiendungen konvertiert werden. Sie können eine Datei mit einer der folgenden Dateiendungen über PhotoWorks öffnen und versuchen, sie in einem anderen, ebenfalls von PhotoWorks unterstützten Dateiformat zu speichern.