Standardmäßig unterstützt jede Software mehrere Dateiendungen. PhotoPlus unterstützt mindestens 8 verschiedene Dateiendungen. Die von PhotoPlus unterstützten Basisdateien sind .DNG. Es werden jedoch nicht immer alle in der Liste aufgeführten Dateiendungen verwendet, um die Auswirkungen der Arbeit in PhotoPlus zu speichern. Sehr oft werden Dateien mit solchen Dateiendungen als Quelldatendateien verwendet, die von PhotoPlus verwendet werden.
Mit PhotoPlus können Dateiformate zwischen den unten aufgeführten Dateiendungen konvertiert werden. Sie können eine Datei mit einer der folgenden Dateiendungen über PhotoPlus öffnen und versuchen, sie in einem anderen, ebenfalls von PhotoPlus unterstützten Dateiformat zu speichern.