Standardmäßig unterstützt jede Software mehrere Dateiendungen. PhotoFiltre unterstützt mindestens 1 verschiedene Dateiendungen. Die von PhotoFiltre unterstützten Basisdateien sind .PFI. Es werden jedoch nicht immer alle in der Liste aufgeführten Dateiendungen verwendet, um die Auswirkungen der Arbeit in PhotoFiltre zu speichern. Sehr oft werden Dateien mit solchen Dateiendungen als Quelldatendateien verwendet, die von PhotoFiltre verwendet werden.
Mit PhotoFiltre können Dateiformate zwischen den unten aufgeführten Dateiendungen konvertiert werden. Sie können eine Datei mit einer der folgenden Dateiendungen über PhotoFiltre öffnen und versuchen, sie in einem anderen, ebenfalls von PhotoFiltre unterstützten Dateiformat zu speichern.